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Réponses physiologique et métabolique du krill aux variations de température du milieu

Acronyme
KREVET

Référence
1039

Domaine de recherche
Vie et environnement

Région
Arctique

AWIPEV-Ny-Alesund

Site
http://www.upmc....in_umr_7144.html

Responsable du projet
Jean-Yves TOULLEC

Laboratoires
Protéines : Biochimie Structurale et Fonctionnelle (CNRS, Université Pierre et Marie Curie)

Date
En cours

Résumé

Conséquences physiologiques d'une augmentation de la température potentiellement liée au réchauffement climatique global chez les Euphausiacés inféodés à l'océan polaire arctique.
- Matériel biologique :

  • Thysanoessa inermis et/ou T. rashii

- Objectifs de recherche :

  • Etude de l'induction des molécules de stress en fonction de la température
  • Analyse comparative des transcriptomes (entre espèces d'Arctique et entre espèces originaires des deux pôles)
  • Analyse différentielle des capacités de réponse au stress thermique

Campagne 2014

La prochaine campagne arctique a comme objectif de compléter les expérimentations de chocs thermiques initiées l'année passée sur T. inermis et T. raschii :
- Conditionnement des animaux avant congélation et analyse au laboratoire : chocs thermiques de durées variables et à des températures de 8 et 12°C afin de pouvoir établir les cinétiques d'expression notamment des Hsp70.
- Réalisation d'une CTmax avec une incrémentation d'1°C/jour sur T. inermis.

Abstract

KREVET : Krill Responses to Variations in Environmental Temperature

Physiological consequences of a possible temperature increase linked to global warming in Euphausids from Arctic ocean.
- Biological material:

  • Thysanoessa inermis and/or T. rashii

- Research objectives:

  • Induction studies of stress molecules as a function of temperature
  • Comparative analysis of transcriptomes (between Arctic species and between Arctic and Antarctic species)
  • Differentiel analysis of response abilities

Campaign 2014

The main objective of this project is to study the molecular adaptation of the krill from Arctic versus Antarctic regions to thermal shocks and to identify possible metabolic pathways implemented during the response. This study will join in vivo physiological experiments and molecular analyses to estimate euphausian thermal tolerances but also to characterize more precisely molecules implied in the response.
In parallel to the study of heat shock proteins, which has already started on Antarctic species, a global search and characterization of new molecular markers, in relation with warmer temperature conditions, will be performed. Illumina sequencing covers the transcriptome of selected Arctic krill species under different experimental conditions. These markers will enable us to estimate temperatures at which animals can be considered as stressed. The study will also focus on structure-function relationships of different isoforms of HSP70, the most studied chaperone molecules implied in thermal stress responses. This part of the work will use species as Thysanoessa inermis and T. raschii.
After the first stay in Ny-Alesund, we have got:
- Thermal shocked animals in different conditions of temperature and time (T. inermis only)
- CTmax estimation with 1°C/10min (T. inermis only)
- Transcriptome of both the species T. inermis and T. raschii. Assemblies just finished. A first transcriptome exploration gives us full-length sequences of Hsp70 orthologous to those from Euphausia species as supplementary new isoforms. However these sequences must be confirmed by RT-PCR approach. It’s currently in progress. Hsp sequences will be used to design molecular probes in order to follow the level of gene expression (qPCR: quantitative PCR) on experimentally shocked animals.
Next stay objectives:
- Thermal shock experiments with T. raschii
- Complementary thermal shock experiments with T. inermis (lost samples)
- CTmax estimation with T. raschii (1°C/10min) and T. inermis (1°C/12h or day)

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